大面积推广应用网箱自动投饵机，受到很多自然条件的制约。由于水库的地理位置大部分处于偏远山区，长江、黄河上水库的条件相对较好，但在全国占有量很少，一般情况电源很难输送到适宜网箱养鱼的库叉岸边。由于水库岸边崎岖不平道路很难修到位，活鱼运输等问题很多地方得不到有效解决。有些地方的养鱼户为了使用网箱投饵机，自备了柴油发电机，在目前油价偏高的情况下，加上油料运输，明显地提高了养殖成本。渔农对加大养鱼成本的投入持观望态度，这是网箱自动投饵机在应用上受限制的主要因素。
在水库中养鱼，对水库的水质造成了一定程度的污染，需要研究出解决的办法。很多地方政府禁止在城市水源性水库养鱼。鱼离不开水，有水必然有鱼。具体在水库中每公顷水面，应放置多少面积的养鱼网箱，目前还没有科学依据。水产界应在这方面加强研究力度，为政府制定政策提供科学依据。这也是制约网箱投饵机应用与发展的因素。
渔农对科学养鱼认识不足。目前大部分是以户为单元的养殖方式，劳动强度很大，一些设施一般是没有能力单独购置，或单独建设的。在出售成鱼的议价环节中也处于弱势状态。因此，网箱养鱼模式也是制约网箱自动投饵机应用与发展的因素。
但是，网箱自动投饵机的应用能够节约饲料10%—20%，降低劳动强度，节约劳动力费用支出，降低养殖管理成本70%—80%。自动投饵机在网箱养鱼中的应用，使渔农从繁重的体力劳动中解脱出来，有更多的时间、精力开展疫病预防、市场销售等管理工作，这也决定了其必将成为未来鱼类养殖的首选。
网箱自动投饵机的普及经过了一个漫长的过程，经过十几年的努力，现在渔农基本上接受了渔业现代化的理念。大力发展网箱自动投饵机不仅给养殖户带来直接经济效益，也将助力国的渔业现代化发展。
